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 マイクロバイオーム創薬・システムバイオロジー解析による研究支援
   
       

TNOの微生物学・システムバイオロジーにおける取組みは、栄養学、医療、バイオテクノロジーにおけるイノベーションで国際的に特に評価の高い分野です。幅広い応用可能な専門知識と柔軟性のあるオペレーション、最新の分析機器、卓越したモデリング技術により 、食品、化学、医薬品、バイオテクノロジー企業とのパートナーシップによる新たなイノベーションの創出に取り組んでいます。




取組み・技術
 疾患バイオマーカー探索・バリデーション: 疾患例;代謝性疾患,NASH,腎障害,線維症,CNS, 他
 マルチオミックス解析(メタゲノム、メタボローム解析)、応用システムズバイオロジー解析
 腸内細菌叢を構成する細菌種、疾患との関係性、標的分子、パスウェイ、メカニズム解析
 口耳鼻腔、皮膚、呼吸器、生殖器等に存在する微生物叢研究
 ワクチン接種時の炎症過程の解明
 Organoids: Host-microbe interaction model
 創薬ターゲットの有効性・安全性プロファイリング in sillico model "Target Tri"開発
 健康体・正常であることの定量化

現在進行中のプロジェクト・コンソーシア
MyNewGut
Power2DM
CarTarDis
CardioPrev
NuGO


Proprietary models
in vitro microbiota i-screenTM platform
  
Mimicking the in vivo microbiome composition in an in vitro system


Poster at 21st North American ISSX meeting, Sep-2017
 I-Screen: In vitro platform to study human gut microbiota induced drugmetabolism and molecular transformations.

  "InTESTine" Human Intestinal Ex vivo model
   
 Dynamic In vitro 胃腸管モデル "TIM


文献情報 (システムズバイオロジー)

A systems biology approach to understand the pathophysiological mechanisms of cardiac pathological hypertrophy associated with rosiglitazone. BMC Med Genomics. 2014 Jun 17
Verschuren L, Wielinga PY, Kelder T, Radonjic M, Salic K, Kleemann R, van Ommen B, Kooistra T.

Differential effects of drug interventions and dietary lifestyle in developing type 2 diabetes and complications: a systems biology analysis in LDLr-/- mice. PLoS One. 2013
Radonjic M, Wielinga PY, Wopereis S, Kelder T, Goelela VS, Verschuren L, Toet K, van Duyvenvoorde W, van der Werff van der Vat B, Stroeve JH, Cnubben N, Kooistra T, van Ommen B, Kleemann R.

Systems biology analysis unravels the complementary action of combined rosuvastatin and ezetimibe therapy
Pharmacogenet Genomics. 2012 Dec;
Verschuren L, Radonjic M, Wielinga PY, Kelder T, Kooistra T, van Ommen B, Kleemann R.


文献情報 (微生物研究)
The human gastrointestinal microbiota--an unexplored frontier for pharmaceutical discovery.
Pharmacol Res. 2012 Dec.
Roeselers G, Bouwman J, Venema K, Montijn R.

Ex vivo systems to study host-microbiota interactions in the gastrointestinal tract.
Best Pract Res Clin Gastroenterol. 2013 Feb.
Roeselers G, Ponomarenko M, Lukovac S, Wortelboer HM

Correlation network analysis reveals relationships between diet-induced changes in human gut microbiota and metabolic health.
Nutr Diabetes. 2014 Jun 30;

Kelder T, Stroeve JH, Bijlsma S, Radonjic M, Roeselers G.

Ex vivo systems to study host-microbiota interactions in the gastrointestinal tract.
Best Pract Res Clin Gastroenterol. 2013 Feb
Roeselers G, Ponomarenko M, Lukovac S, Wortelboer HM.

Differential modulation by Akkermansia muciniphila and Faecalibacterium prausnitzii of host peripheral lipid metabolism and histone acetylation in mouse gut organoids.
MBio. 2014 Aug
Lukovac S, Belzer C, Pellis L, Keijser BJ, de Vos WM, Montijn RC, Roeselers G.

In vitro characterization of the impact of different substrates on metabolite production, energy extraction and composition of gut microbiota from lean and obese subjects.
PLoS One. 2014 Nov.
Aguirre M, Jonkers DM, Troost FJ, Roeselers G, Venema K.

Deep sequencing analyses of low density microbial communities: working at the boundary of accurate microbiota detection.
PLoS One. 2012..
Biesbroek G, Sanders EA, Roeselers G, Wang X, Caspers MP, Trzci?ski K, Bogaert D, Keijser BJ.

Microbial biogeography of drinking water: patterns in phylogenetic diversity across space and time.
Environmental Microbiology. doi: 10.1111/1462-2920.12739. .
Roeselers G, Coolen J, van der Wielen PW, Jaspers MC, Atsma A, de Graaf B, Schuren F.


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